Weir博士重获新生,McKay博士试图拯救遭受复元帅府的势力仍然占据着北、中、南三个地区。东、西二区名义上已经归于相阁控制,不过网络上也有消息称,东区镇守将军童星光的妹妹童月华虽然名义上仍然归于相阁领导,但实际上,童月华所领导的东区,无论是在军事上,还是经济上都已经独立了,相阁以及首相陆明仁对东区的影响力已经微乎其微。制者攻击后早已成千疮百孔的亚特兰蒂斯。可供使用的能源仅可维持24小时,又无法使用星际之门,亚特兰蒂斯小队能否再次战胜世界末日......McKay与Sheppard计划从复制者的手中夺回ZPM。而与此同时,Samantha Carter会同Apollo正在找寻传说中遗失的城市--亚特兰蒂斯。McKay他们的计划能否成功?Carter能否找到遗失城市的所在?